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京都基因和基因组百科全书

KEGG(京都基因和基因组百科全书)是一个基于分子层面信息解析生物系统——包括细胞、个体乃至生态系统——高层次功能的综合性数据库,重点整合基因组测序及各类高通量分子组学实验所...

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京都基因和基因组百科全书相关介绍

GenomeNet是日本京都大学设立的基因组研究数据库网络,提供KEGG(京都基因与基因组百科全书)、DBGET(综合数据库检索系统)等核心资源。其数据库涵盖基因组信息(KEGG GENES)、化学物质(KEGG LIGAND)、健康数据(KEGG MEDICUS)及宏基因组目录(MGENES)等,支持通过DBGET和LinkDB进行跨库检索,并提供SPARQL端点供语义查询。生物信息学工具板块包含序列分析(BLAST/FASTA、MAFFT多序列比对)、基因组分析(动态基因组比对、病毒蛋白树构建)、化学分析(化学结构相似性搜索)及网络预测(基因网络、药物靶点网络)等功能,如DeepKOALA基于深度学习的基因功能注释、KAAS自动KEGG注释服务器等。此外,平台还提供病毒宿主数据库、反应本体分类及代谢网络设计工具(MetNetComp DB),服务于生物医学领域的基因功能解析、代谢途径研究及药物开发等场景。

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